El fondo consiste, en su mayoría, de copias de cartas e informes recibidos y enviados por John William Cooke durante el año 1958, período marcado por la proscripción del peronismo como fuerza electoral y el exilio de su líder, Juan Domingo Perón. Ese año se encuentra marcado por las negociaciones entre Perón y el candidato radical a la presidencia Arturo Frondizi para que los sectores peronistas apoyaran la candidatura de Frondizi en las elecciones.
Las cartas -enviadas a Cooke en su carácter de Jefe de la Dirección de Operaciones del Comando Superior Peronista, organismo articulador de la llamada "resistencia peronista"- demuestran las diversas articulaciones locales, el análisis de la situación política y sindical (sobre todo, las disputas intersindicales en el seno de la Confederación General del Trabajo) y la forma operativa en la que actuaban distintas células del comando de la resistencia.
Una gran parte de los corresponsales son dirigentes sindicales (como José Espejo o José Alonso) y dirigentes políticos y militares (como el Mayor Vicente) que se encontraban en distintos puntos del continente, como Quito, Asunción, Montevideo, etc. Algunas de las epístolas estaban destinadas a Juan Domingo Perón, ya que Cooke se encargaba de enviárselas al General en su exilio.
Los informes y resoluciones disponibles son:

• "Actualidad Gremial Argentina"
• "Golpe de vista sobre la situación argentina a fines de Junio de 1958"
• "Antrproyecto de plan de organización Capital Federal"
• "Ley de Asociaciones Profesionales"
• Acta N°1 [de creación del Centro de Ayuda Social "Eva Perón"]
• Resolución de la Comisión Nacional Provisoria del Movimiento Peronista Ortodoxo Intransigente, 20/09/1958
• Estatuto de la Fundación "Misioneras de Eva Perón"

El documento consiste en la transcripción mecanografiada (con correcciones manuscritas) del Plenario de Psiquiatras comunistas cuya fecha de realización se estima que es junio de 1964 (ver documento adjunto).
En dicho plenario participaban, según concluye Hugo Vezzetti, 45 personas, de las cuales 30 eran miembros del Partido Comunista.
Se encontraban presentes, de acuerdo a las intervenciones: César Cabral, Jorge Thénon, José Itzigsohn, Juan Carlos Distéfano, Gervasio Paz, Juan Peluffo, Adolfo Lértora, Antonio Caparrós. Se incluye, además, la participación del Secretario General del Partido Comunista, Rodolfo Ghioldi.
En estas intervenciones versan sobre diversos aspectos ideológicos vinculados al ejercicio de la Psiquiatría, la coyuntura política, la vinculación con el Partido Comunista, la situación internacional y las acciones concretas en espacios académicos e institucionales por parte de este grupo de profesionales.

El Fondo Samuel Shmerkin ostenta rasgos propios tanto del "archivo personal" como del "archivo judicial". Por un lado, se trata de una selección de documentos y copias de expedientes judiciales en el ejercicio de la actividad de abogado laboralista y en tanto miembro de la Comisión Jurídica Nacional del PC realizada por una persona física (Samuel Shmerkin) a lo largo de toda su vida. En simultáneo, de la conformación de un archivo personal de recortes periódicos, volantes y folletos. Por otro lado, es "huella en bruto de vidas que de ningún modo pedían expresarse así, y que están obligadas a hacerlo porque un día se vieron enfrentadas a las realidades de la policía y de la represión" (Farge 1991: 10), conteniendo desde transcripciones de declaraciones indagatorias hasta esquelas manuscritas enviadas desde prisión por parte de los acusados, miembros de diversas Federaciones y sindicatos de trabajadores y asociaciones culturales judías. El proceso de interfoliado y datación de los 3882 documentos que constituyen el Fondo Shmerkin reveló que las carpetas contenían asimismo prolijísimos dossiers sobre temas como la pérdida de la personería electoral del PCA -provincia por provincia- en el año 1965 y sobre las principales editoriales comunistas: Lautaro, Cartago, Librería y Editorial "Problemas" y Ediciones Cultura.