El Espacio Memoria y Derechos Humanos surge a partir del convenio firmado en 2004 entre los gobiernos de la Nación y de la Ciudad de Buenos Aires para su creación en el predio que funcionara anteriormente la Escuela de Mecánica de la Armada (ESMA), el cual fue utilizado como centro clandestino de torturas durante la última dictadura militar argentina. En sus instalaciones se realizan actividades vinculadas con la defensa de derechos humanos a través de propuestas artísticas, museográficas y educativas. Incluye espacios de investigación y conservación del acervo documental y archivístico de la Argentina con énfasis en la temática del terrorismo de Estado.
El ente está compuesto por un Órgano Ejecutivo tripartito integrado por representantes del Directorio de Organismos de Derechos Humanos, del Poder Ejecutivo Nacional y del Gobierno de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires.